三、行分
当机请位
阿难即从座起，顶礼佛足而白佛言：我辈愚钝，好为多闻，于诸漏心，未求出离，蒙佛慈诲，得正熏修，身心快然，获大饶益。世尊！如是修证佛三摩提，未到涅槃，云何名为干慧之地？四十四心，至何渐次，得修行目？诣何方所，名入地中？云何名为等觉菩萨？作是语已，五体投地，大众一心伫佛慈音，瞪懵瞻仰。尔时，世尊赞阿难言：善哉！善哉！汝等乃能普为大众及诸末世一切众生，修三摩提求大乘者，从于凡夫终大涅槃，悬示无上正修行路，汝今谛听，当为汝说。阿难大众，合掌刳心，默然受教。
【分义】此始为行分，示禅那妙行，令住圆定，定慧双融，历位修证。即答阿难妙禅那之请。前定分如得门而入，此行分如升堂入室之次第。此当机请问修证位次。干慧地者，谓欲爱干枯，根境不偶，即信前一位，为发足修行最初之因。所谓渐次者，即最初干慧之前三渐次。由十信、十住、十行、十回向至四加行，故名四十四心。加上十地等觉，故成五十五位真菩提路。妙觉乃涅槃之妙果。
二转依号
佛言！阿难当知，妙性圆明，离诸名相，本来无有世界众生，因妄有生，因生有灭，生灭名妄，灭妄名真。是称如来无上菩提及大涅槃二转依号。
【分义】此正示二转依号。先立一真法界如来藏性为生死涅槃之因。妙性圆明，离诸名相，本无世界众生者，是直指一心真源，永离诸妄。以最初一念不觉妄动，因而有生，因生而有灭，因有生灭，故名为妄。因灭生灭，即无生灭性，故名为真。真妄因依，故有转烦恼为菩提，转生死为涅槃，是则名为二转依号。此凡圣二路，皆由迷悟而立，本来无有。
二颠倒因
阿难！汝今欲修真三摩地，直诣如来大涅槃者。先当识此众生、世界二颠倒因，颠倒不生，斯则如来真三摩地。
【分义】今返妄归真，只在即妄以明真，非舍妄以求真。只在能识破众生世界二颠倒之因，颠倒不生，便是真三摩地。二颠倒因者，即众生颠倒和世界颠倒之因。
一众生颠倒因
阿难！云何名为众生颠倒？阿难！由性明心，性明圆故，因明发性，性妄见生，从毕竟无，成究竟有，此有所有，非因所因，住所住相，了无根本，本此无住，建立世界及诸众生。迷本圆明，是生虚妄。妄性无体，非有所依，将欲复真，欲真已非真真如性，非真求复，宛成非相。非生非住，非心非法，展转发生，生力发明，熏以成业，同业相感，因有感业，相灭相生。由是故有众生颠倒。
【分义】此示众生颠倒因。妙性本明，圆照法界。由于众生迷本圆明，性上加明而生妄见。故言由明发性，性妄见生。即前经言：所妄既立，生汝妄能。谓由所发妄相遂起能见之妄见，则众生世界宛然，生死轮回因之而立。故言从毕竟无成究竟有。然而此无明妄见与所有众生世界，当体虚妄，如空中花，梦中物，本无所有。即此无明与众生世界，本无所因而妄为所因。能住之众生与所住之世界，本自非有，全体虚妄，了无根本。此显众生世界本无。本来无住，而建立众生世界之妄法。此明众生颠倒。生住心法，本无自性。於此非生非住非心非法，而妄见有生有住有心有法。从此虚妄展转发生，熏以成业，同业相感，而有生灭，从此非有而妄成有。由是故有九界众生颠倒。
二世界颠倒因
阿难！云何名为世界颠倒？是有所有，分段妄生，因此界立。非因所因，无住所住，迁流不住，因此世成。三世四方，和合相涉，变化众生，成十二类。是故世界因动有声，因声有色，因色有香，因香有触，因触有味，因味知法，六乱妄想，成业性故，十二区分，由此轮转。
【分义】此示世界颠倒因。实相本来空寂，了无所有。因能有之无明妄心，故吸四大外色而成根身器界为所有。所谓所妄既立，明理不逾，故分段妄生。因此东西南北妄成界限，故言因此界立。以妄心无体，本无有因而妄认所因。妄身本空无住而妄执所住器界，则妄心生灭迁流不息，而形成过去现在未来三世之妄相。故言因此世成。由三世四方和合不思议熏变，故变化众生成十二类。是故世界十二类生，皆因一念无明妄动，而有知声色香味触法六乱妄想。由此六乱妄想生灭不停为缘，熏变成业性而为生死因，是故十二区分众生而为受生之果。由此生灭熏变不止，轮转不休。所以众生世界颠倒不息。
