乙三 明诸部通别门
　　　丙一 标通别二论

　　次明诸部通别义。论有二种：一者通论，二者别论。
　　此文标通论与别论两种：下文也称通申论和别申论。“申”是申明、申展，是解释显了意。本为释经，所以造论，故经为所申，论为能申。明代藕益智旭，亦明二论，谓宗经论和释经论。今明通别二论，皆为释经，通论通释诸经要义，别论别解一部经文。

　　丙二 释通别二论
　　　丁一 就大乘论明通别

　　若通破大小二迷，通申大小二教，名为通论，即《中论》是也。故前二十五品，破大迷，申大教，后两品，破小迷申小教。二者别论，别破大小迷，别申大小教，名为别论。如《摄大乘论》、《地持论》等，谓大乘通论，《十地论》、《智度论》等，大乘别论。
　　此又有二种：一者，通破大小乘二迷，通申大小乘两教者，名为大小乘通论；别破大小乘二迷，别申大小乘两教者，为大小别论。通申大小乘两教者，如《中观论》，前二十五品，破大乘迷，申大乘教，后两品，破小乘迷，申小乘教，故名大小乘通论。别申论者，别破大小乘迷，别申大小乘教者，此事易知，如《大乘起信论》别申大乘教，故是大乘别论，《成实》、《俱舍》别申小乘，故是小乘别论。这是双申大小乘两教为通申论，各别解释大小乘两教为别申论。二者，但就大乘论中辨通别，如《大乘起信论》、《摄大乘论》通释大乘教义，故是大乘通申论，《十地经论》、《大智度论》，只别释大乘中一部经，故名别申论。

　　丁二 就小乘论明通别

　　如《成实论》等，通申三藏，谓小乘通论，马鸣菩萨师名胁比丘，造《四阿含优婆提舍》，别释修多罗藏，《善见毗婆沙》别释毗尼藏。《智度论》云：八十部律，八十部毗婆沙释之。《善见律》别释师子国《要用十诵律》。舍利弗别释佛九分毗昙。如此别释三藏，故是小乘别论。就三藏中复有通别，若具释一藏，名为通论，别释一藏中一部，名为别论也。
　　就小乘论明通别，也有二种：一就经律论三藏辨通别，二就一藏明通别。通释经律论三藏，名为通论，如《成实》、《俱舍》等，经律论的教义教相皆谈，通释小乘三藏，故是通申论。别释三藏中一藏，名为别申论。如胁尊者造《四阿含论》，别释经藏，《善见毗婆沙》别释律藏，舍利弗造《法藏论》，一般名为《舍利弗毗昙》，唐译为《集异门论》，解佛九分毗昙，别释论藏，如此别释三藏，故是小乘别论。次就三藏中一藏辨通别者，通释一藏名通申论，若别释一藏中一部的，名别申论。

　　丙三 别释三论通别

　　问：《中论》既释大小，应名大小通论，不得名为大乘论也？答：虽释大小，但为显大，故是大乘通论。所以然者，以初分明大乘，中分明小乘，后分还明大乘故，以是义故，名大乘论耳。问：《十二门论》是何论耶？答：是大乘通论。以始终破于大迷，通申大教，无破小迷，别申于小教，故是大乘通论也。问：《百论》复云何？答：《百论》通破障大小乘之邪，通申如来大小两正，故是大小乘通论，但始终为明大乘，故属大乘通论耳。
　　辨三论通别者，《中论》和《百论》若就大小乘合辨通别，皆属大小乘通论，章主自有解说。《十二门论》独申大教，无释小乘文处，故是别论。若就大乘中自辨通别者，《十二门论》通申大乘深义，故是大乘通论，不别释某一经，故不属别论。故《中》、《百》、《门》三论，皆是大乘通论。